Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms