Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms