Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI46

DNAI1, Dynein intermediate chain 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAI1Q9UI46 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNAI1Q9UI46 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNAI1Q9UI46 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNAI1Q9UI46 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNAI1Q9UI46 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAI1Q9UI46 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAI1Q9UI46 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAI1Q9UI46 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAI1Q9UI46 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAI1Q9UI46 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAI1Q9UI46 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAI1Q9UI46 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAI1Q9UI46 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAI1Q9UI46 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAI1Q9UI46 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAI1Q9UI46 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAI1Q9UI46 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAI1Q9UI46 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAI1Q9UI46 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAI1Q9UI46 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAI1Q9UI46 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAI1Q9UI46 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAI1Q9UI46 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAI1Q9UI46 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAI1Q9UI46 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAI1Q9UI46 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAI1Q9UI46 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAI1Q9UI46 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAI1Q9UI46 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAI1Q9UI46 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAI1Q9UI46 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAI1Q9UI46 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAI1Q9UI46 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAI1Q9UI46 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAI1Q9UI46 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAI1Q9UI46 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAI1Q9UI46 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAI1Q9UI46 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAI1Q9UI46 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms