Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SFMBT1Q9UHJ3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms