Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHORDC1Q9UHD1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms