Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NPC1L1Q9UHC9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NPC1L1Q9UHC9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NPC1L1Q9UHC9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NPC1L1Q9UHC9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NPC1L1Q9UHC9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NPC1L1Q9UHC9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NPC1L1Q9UHC9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NPC1L1Q9UHC9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NPC1L1Q9UHC9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
NPC1L1Q9UHC9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NPC1L1Q9UHC9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NPC1L1Q9UHC9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NPC1L1Q9UHC9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
NPC1L1Q9UHC9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
NPC1L1Q9UHC9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
NPC1L1Q9UHC9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NPC1L1Q9UHC9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NPC1L1Q9UHC9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NPC1L1Q9UHC9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NPC1L1Q9UHC9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NPC1L1Q9UHC9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NPC1L1Q9UHC9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NPC1L1Q9UHC9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NPC1L1Q9UHC9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NPC1L1Q9UHC9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NPC1L1Q9UHC9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NPC1L1Q9UHC9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NPC1L1Q9UHC9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NPC1L1Q9UHC9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NPC1L1Q9UHC9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NPC1L1Q9UHC9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NPC1L1Q9UHC9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NPC1L1Q9UHC9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NPC1L1Q9UHC9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NPC1L1Q9UHC9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NPC1L1Q9UHC9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NPC1L1Q9UHC9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NPC1L1Q9UHC9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NPC1L1Q9UHC9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NPC1L1Q9UHC9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NPC1L1Q9UHC9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NPC1L1Q9UHC9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
NPC1L1Q9UHC9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NPC1L1Q9UHC9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NPC1L1Q9UHC9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NPC1L1Q9UHC9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NPC1L1Q9UHC9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NPC1L1Q9UHC9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NPC1L1Q9UHC9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
NPC1L1Q9UHC9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
NPC1L1Q9UHC9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NPC1L1Q9UHC9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NPC1L1Q9UHC9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NPC1L1Q9UHC9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NPC1L1Q9UHC9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NPC1L1Q9UHC9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NPC1L1Q9UHC9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
NPC1L1Q9UHC9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
NPC1L1Q9UHC9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.41
NPC1L1Q9UHC9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
NPC1L1Q9UHC9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NPC1L1Q9UHC9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NPC1L1Q9UHC9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NPC1L1Q9UHC9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NPC1L1Q9UHC9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NPC1L1Q9UHC9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NPC1L1Q9UHC9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NPC1L1Q9UHC9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NPC1L1Q9UHC9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NPC1L1Q9UHC9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NPC1L1Q9UHC9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NPC1L1Q9UHC9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NPC1L1Q9UHC9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
NPC1L1Q9UHC9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
NPC1L1Q9UHC9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NPC1L1Q9UHC9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NPC1L1Q9UHC9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NPC1L1Q9UHC9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NPC1L1Q9UHC9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
NPC1L1Q9UHC9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NPC1L1Q9UHC9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NPC1L1Q9UHC9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NPC1L1Q9UHC9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NPC1L1Q9UHC9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NPC1L1Q9UHC9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NPC1L1Q9UHC9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NPC1L1Q9UHC9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
NPC1L1Q9UHC9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NPC1L1Q9UHC9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NPC1L1Q9UHC9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
NPC1L1Q9UHC9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NPC1L1Q9UHC9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NPC1L1Q9UHC9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NPC1L1Q9UHC9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NPC1L1Q9UHC9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NPC1L1Q9UHC9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
NPC1L1Q9UHC9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NPC1L1Q9UHC9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NPC1L1Q9UHC9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms