Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HMGXB4Q9UGU5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HMGXB4Q9UGU5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms