Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCF20Q9UGU0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCF20Q9UGU0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms