Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms