Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms