Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2W1

PSMC3IP, Homologous-pairing protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC3IPQ9P2W1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMC3IPQ9P2W1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMC3IPQ9P2W1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms