Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M7

CGN, Cingulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNQ9P2M7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms