Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E8

MARCH4, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH4Q9P2E8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH4Q9P2E8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms