Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDH10Q9P2E7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms