Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHPF2Q9P2E5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHPF2Q9P2E5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHPF2Q9P2E5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHPF2Q9P2E5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHPF2Q9P2E5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CHPF2Q9P2E5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHPF2Q9P2E5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms