Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms