Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MSRB1Q9NZV6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MSRB1Q9NZV6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MSRB1Q9NZV6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MSRB1Q9NZV6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MSRB1Q9NZV6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MSRB1Q9NZV6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MSRB1Q9NZV6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MSRB1Q9NZV6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MSRB1Q9NZV6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MSRB1Q9NZV6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MSRB1Q9NZV6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MSRB1Q9NZV6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MSRB1Q9NZV6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MSRB1Q9NZV6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MSRB1Q9NZV6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MSRB1Q9NZV6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MSRB1Q9NZV6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MSRB1Q9NZV6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MSRB1Q9NZV6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MSRB1Q9NZV6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MSRB1Q9NZV6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MSRB1Q9NZV6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MSRB1Q9NZV6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MSRB1Q9NZV6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MSRB1Q9NZV6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MSRB1Q9NZV6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MSRB1Q9NZV6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MSRB1Q9NZV6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MSRB1Q9NZV6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MSRB1Q9NZV6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MSRB1Q9NZV6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MSRB1Q9NZV6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MSRB1Q9NZV6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MSRB1Q9NZV6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MSRB1Q9NZV6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MSRB1Q9NZV6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MSRB1Q9NZV6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MSRB1Q9NZV6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MSRB1Q9NZV6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MSRB1Q9NZV6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MSRB1Q9NZV6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MSRB1Q9NZV6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MSRB1Q9NZV6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MSRB1Q9NZV6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MSRB1Q9NZV6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MSRB1Q9NZV6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MSRB1Q9NZV6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms