Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM1

MYOF, Myoferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOFQ9NZM1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYOFQ9NZM1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MYOFQ9NZM1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms