Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNIP1Q9NZI2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNIP1Q9NZI2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNIP1Q9NZI2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNIP1Q9NZI2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNIP1Q9NZI2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNIP1Q9NZI2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNIP1Q9NZI2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNIP1Q9NZI2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNIP1Q9NZI2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNIP1Q9NZI2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNIP1Q9NZI2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNIP1Q9NZI2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNIP1Q9NZI2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNIP1Q9NZI2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNIP1Q9NZI2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP1Q9NZI2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP1Q9NZI2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP1Q9NZI2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP1Q9NZI2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP1Q9NZI2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP1Q9NZI2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP1Q9NZI2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP1Q9NZI2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP1Q9NZI2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP1Q9NZI2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP1Q9NZI2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP1Q9NZI2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP1Q9NZI2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP1Q9NZI2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP1Q9NZI2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP1Q9NZI2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP1Q9NZI2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP1Q9NZI2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP1Q9NZI2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP1Q9NZI2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP1Q9NZI2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNIP1Q9NZI2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNIP1Q9NZI2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNIP1Q9NZI2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNIP1Q9NZI2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNIP1Q9NZI2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNIP1Q9NZI2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNIP1Q9NZI2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms