Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
C9orf78Q9NZ63 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C9orf78Q9NZ63 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms