Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ3

GTSE1, G2 and S phase-expressed protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTSE1Q9NYZ3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GTSE1Q9NYZ3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTSE1Q9NYZ3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTSE1Q9NYZ3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTSE1Q9NYZ3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTSE1Q9NYZ3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTSE1Q9NYZ3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTSE1Q9NYZ3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTSE1Q9NYZ3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTSE1Q9NYZ3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTSE1Q9NYZ3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTSE1Q9NYZ3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTSE1Q9NYZ3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTSE1Q9NYZ3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTSE1Q9NYZ3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTSE1Q9NYZ3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTSE1Q9NYZ3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTSE1Q9NYZ3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTSE1Q9NYZ3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTSE1Q9NYZ3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTSE1Q9NYZ3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTSE1Q9NYZ3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GTSE1Q9NYZ3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTSE1Q9NYZ3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GTSE1Q9NYZ3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GTSE1Q9NYZ3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GTSE1Q9NYZ3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GTSE1Q9NYZ3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms