Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY43

BARHL2, BarH-like 2 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL2Q9NY43 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BARHL2Q9NY43 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BARHL2Q9NY43 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BARHL2Q9NY43 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BARHL2Q9NY43 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BARHL2Q9NY43 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
BARHL2Q9NY43 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BARHL2Q9NY43 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
BARHL2Q9NY43 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BARHL2Q9NY43 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BARHL2Q9NY43 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms