Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms