Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
KLHL11Q9NVR0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms