Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
FBXO28Q9NVF7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms