Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TREX1Q9NSU2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TREX1Q9NSU2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms