Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GKN1Q9NS71 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
GKN1Q9NS71 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GKN1Q9NS71 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GKN1Q9NS71 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GKN1Q9NS71 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GKN1Q9NS71 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GKN1Q9NS71 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GKN1Q9NS71 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GKN1Q9NS71 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms