Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY6

PLSCR3, Phospholipid scramblase 3, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLSCR3Q9NRY6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PLSCR3Q9NRY6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLSCR3Q9NRY6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLSCR3Q9NRY6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLSCR3Q9NRY6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLSCR3Q9NRY6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLSCR3Q9NRY6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PLSCR3Q9NRY6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLSCR3Q9NRY6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLSCR3Q9NRY6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLSCR3Q9NRY6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLSCR3Q9NRY6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLSCR3Q9NRY6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLSCR3Q9NRY6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLSCR3Q9NRY6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLSCR3Q9NRY6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLSCR3Q9NRY6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLSCR3Q9NRY6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLSCR3Q9NRY6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLSCR3Q9NRY6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLSCR3Q9NRY6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLSCR3Q9NRY6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLSCR3Q9NRY6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLSCR3Q9NRY6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLSCR3Q9NRY6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLSCR3Q9NRY6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLSCR3Q9NRY6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLSCR3Q9NRY6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLSCR3Q9NRY6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLSCR3Q9NRY6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLSCR3Q9NRY6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLSCR3Q9NRY6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLSCR3Q9NRY6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLSCR3Q9NRY6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLSCR3Q9NRY6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLSCR3Q9NRY6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLSCR3Q9NRY6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLSCR3Q9NRY6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLSCR3Q9NRY6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLSCR3Q9NRY6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLSCR3Q9NRY6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLSCR3Q9NRY6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PLSCR3Q9NRY6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLSCR3Q9NRY6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLSCR3Q9NRY6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLSCR3Q9NRY6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PLSCR3Q9NRY6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLSCR3Q9NRY6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLSCR3Q9NRY6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLSCR3Q9NRY6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLSCR3Q9NRY6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms