Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPRSS4Q9NRS4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms