Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms