Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR33

POLE4, DNA polymerase epsilon subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE4Q9NR33 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLE4Q9NR33 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLE4Q9NR33 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms