Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRDM8Q9NQV8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRDM8Q9NQV8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM8Q9NQV8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM8Q9NQV8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM8Q9NQV8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM8Q9NQV8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM8Q9NQV8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM8Q9NQV8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM8Q9NQV8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM8Q9NQV8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM8Q9NQV8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM8Q9NQV8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM8Q9NQV8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM8Q9NQV8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM8Q9NQV8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM8Q9NQV8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM8Q9NQV8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM8Q9NQV8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM8Q9NQV8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM8Q9NQV8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM8Q9NQV8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM8Q9NQV8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM8Q9NQV8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM8Q9NQV8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM8Q9NQV8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM8Q9NQV8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM8Q9NQV8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM8Q9NQV8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM8Q9NQV8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM8Q9NQV8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM8Q9NQV8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms