Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
INCENPQ9NQS7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
INCENPQ9NQS7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
INCENPQ9NQS7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
INCENPQ9NQS7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
INCENPQ9NQS7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
INCENPQ9NQS7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
INCENPQ9NQS7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
INCENPQ9NQS7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
INCENPQ9NQS7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
INCENPQ9NQS7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
INCENPQ9NQS7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
INCENPQ9NQS7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
INCENPQ9NQS7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
INCENPQ9NQS7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
INCENPQ9NQS7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
INCENPQ9NQS7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
INCENPQ9NQS7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
INCENPQ9NQS7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
INCENPQ9NQS7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
INCENPQ9NQS7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
INCENPQ9NQS7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
INCENPQ9NQS7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
INCENPQ9NQS7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
INCENPQ9NQS7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
INCENPQ9NQS7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
INCENPQ9NQS7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
INCENPQ9NQS7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
INCENPQ9NQS7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
INCENPQ9NQS7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
INCENPQ9NQS7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
INCENPQ9NQS7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
INCENPQ9NQS7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.1 ms