Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ASCL3Q9NQ33 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms