Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ03

SCRT2, Transcriptional repressor scratch 2, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRT2Q9NQ03 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCRT2Q9NQ03 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCRT2Q9NQ03 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCRT2Q9NQ03 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCRT2Q9NQ03 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCRT2Q9NQ03 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCRT2Q9NQ03 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCRT2Q9NQ03 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCRT2Q9NQ03 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCRT2Q9NQ03 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCRT2Q9NQ03 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCRT2Q9NQ03 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCRT2Q9NQ03 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCRT2Q9NQ03 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCRT2Q9NQ03 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCRT2Q9NQ03 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCRT2Q9NQ03 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCRT2Q9NQ03 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCRT2Q9NQ03 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCRT2Q9NQ03 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCRT2Q9NQ03 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCRT2Q9NQ03 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCRT2Q9NQ03 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCRT2Q9NQ03 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCRT2Q9NQ03 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCRT2Q9NQ03 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCRT2Q9NQ03 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCRT2Q9NQ03 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCRT2Q9NQ03 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCRT2Q9NQ03 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCRT2Q9NQ03 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCRT2Q9NQ03 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCRT2Q9NQ03 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCRT2Q9NQ03 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCRT2Q9NQ03 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCRT2Q9NQ03 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SCRT2Q9NQ03 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCRT2Q9NQ03 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCRT2Q9NQ03 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCRT2Q9NQ03 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms