Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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