Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms