Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GPCPD1Q9NPB8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPCPD1Q9NPB8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPCPD1Q9NPB8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPCPD1Q9NPB8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPCPD1Q9NPB8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPCPD1Q9NPB8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPCPD1Q9NPB8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPCPD1Q9NPB8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPCPD1Q9NPB8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GPCPD1Q9NPB8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPCPD1Q9NPB8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPCPD1Q9NPB8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPCPD1Q9NPB8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPCPD1Q9NPB8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPCPD1Q9NPB8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPCPD1Q9NPB8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPCPD1Q9NPB8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPCPD1Q9NPB8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPCPD1Q9NPB8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPCPD1Q9NPB8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPCPD1Q9NPB8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPCPD1Q9NPB8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPCPD1Q9NPB8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPCPD1Q9NPB8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPCPD1Q9NPB8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPCPD1Q9NPB8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPCPD1Q9NPB8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPCPD1Q9NPB8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPCPD1Q9NPB8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPCPD1Q9NPB8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPCPD1Q9NPB8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPCPD1Q9NPB8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPCPD1Q9NPB8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPCPD1Q9NPB8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPCPD1Q9NPB8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPCPD1Q9NPB8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GPCPD1Q9NPB8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPCPD1Q9NPB8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPCPD1Q9NPB8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPCPD1Q9NPB8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPCPD1Q9NPB8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPCPD1Q9NPB8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPCPD1Q9NPB8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPCPD1Q9NPB8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPCPD1Q9NPB8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPCPD1Q9NPB8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPCPD1Q9NPB8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPCPD1Q9NPB8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms