Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP78

ABCB9, ATP-binding cassette sub-family B member 9, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB9Q9NP78 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCB9Q9NP78 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCB9Q9NP78 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCB9Q9NP78 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCB9Q9NP78 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCB9Q9NP78 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCB9Q9NP78 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCB9Q9NP78 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCB9Q9NP78 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCB9Q9NP78 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCB9Q9NP78 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCB9Q9NP78 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCB9Q9NP78 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCB9Q9NP78 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCB9Q9NP78 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCB9Q9NP78 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCB9Q9NP78 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCB9Q9NP78 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCB9Q9NP78 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCB9Q9NP78 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCB9Q9NP78 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ABCB9Q9NP78 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms