Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU5

PREB, Prolactin regulatory element-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREBQ9HCU5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms