Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCL2

GPAM, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAMQ9HCL2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPAMQ9HCL2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPAMQ9HCL2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPAMQ9HCL2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPAMQ9HCL2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPAMQ9HCL2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPAMQ9HCL2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPAMQ9HCL2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPAMQ9HCL2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPAMQ9HCL2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPAMQ9HCL2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPAMQ9HCL2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPAMQ9HCL2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPAMQ9HCL2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPAMQ9HCL2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPAMQ9HCL2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPAMQ9HCL2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPAMQ9HCL2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPAMQ9HCL2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPAMQ9HCL2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPAMQ9HCL2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPAMQ9HCL2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPAMQ9HCL2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPAMQ9HCL2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPAMQ9HCL2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPAMQ9HCL2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GPAMQ9HCL2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms