Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms