Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBF4

ZFYVE1, Zinc finger FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE1Q9HBF4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZFYVE1Q9HBF4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZFYVE1Q9HBF4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZFYVE1Q9HBF4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZFYVE1Q9HBF4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZFYVE1Q9HBF4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZFYVE1Q9HBF4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZFYVE1Q9HBF4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZFYVE1Q9HBF4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZFYVE1Q9HBF4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZFYVE1Q9HBF4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZFYVE1Q9HBF4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZFYVE1Q9HBF4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZFYVE1Q9HBF4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZFYVE1Q9HBF4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZFYVE1Q9HBF4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZFYVE1Q9HBF4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZFYVE1Q9HBF4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZFYVE1Q9HBF4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZFYVE1Q9HBF4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZFYVE1Q9HBF4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZFYVE1Q9HBF4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZFYVE1Q9HBF4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZFYVE1Q9HBF4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZFYVE1Q9HBF4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZFYVE1Q9HBF4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZFYVE1Q9HBF4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZFYVE1Q9HBF4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZFYVE1Q9HBF4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZFYVE1Q9HBF4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZFYVE1Q9HBF4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZFYVE1Q9HBF4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZFYVE1Q9HBF4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZFYVE1Q9HBF4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms