Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAK2

EBF2, Transcription factor COE2, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF2Q9HAK2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EBF2Q9HAK2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms