Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUDS3Q9H7L9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms