Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7F0

ATP13A3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A3Q9H7F0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP13A3Q9H7F0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP13A3Q9H7F0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP13A3Q9H7F0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP13A3Q9H7F0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP13A3Q9H7F0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP13A3Q9H7F0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP13A3Q9H7F0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP13A3Q9H7F0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP13A3Q9H7F0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP13A3Q9H7F0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP13A3Q9H7F0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP13A3Q9H7F0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP13A3Q9H7F0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP13A3Q9H7F0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP13A3Q9H7F0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP13A3Q9H7F0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP13A3Q9H7F0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP13A3Q9H7F0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP13A3Q9H7F0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP13A3Q9H7F0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP13A3Q9H7F0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP13A3Q9H7F0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP13A3Q9H7F0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms