Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
C11orf49Q9H6J7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms