Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D8

FNDC4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC4Q9H6D8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FNDC4Q9H6D8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms