Protein–RNA interactions for Protein: Q9H668

STN1, CST complex subunit STN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STN1Q9H668 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STN1Q9H668 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms