Protein–RNA interactions for Protein: Q9H300

PARL, Presenilins-associated rhomboid-like protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARLQ9H300 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PARLQ9H300 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PARLQ9H300 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms